Где брать качественные продукты?

Не туда воюем. Гораздо сильнее повлияет на качество жизни не "качество" продуктов, а их набор. Условно, приготовленная своими руками картошка с мясом из ближайшего магазина (я не говорю про откровенный брак/просрочку) с огромной долей вероятности будет несколько более предсказуемой по составу чем условные чипсы с сосисками из любого био-эко маркета.
Насколько я знаю, в России довольно строгие законы по качеству пищевой продукции и по достоверности описания состава. Конечно, факапы бывают везде, но в среднем по больнице мясо/фрукты/овощи из Окея/Ленты/Ашана скорее всего будет достаточно качественным и безопасным для повседневного потребления.
И да, все бабушки у метро и каджиты на рынках закупаются на совершенно одинаковых оптовых базах. Куда везут одни и те же помидоры одними и теми же фурами.

Отвечая на вопросы по пунктам:

1. Как конкретно можно повысить качество покупаемых продуктов и готовой еды? Достаточно ли покупать то, что подороже (скорее всего, нет).

Покупать продукт максимально близко к его изначальной форме. Пользоваться органами чувств которые дала природа - продукт должен быть красивым и аппетитным, вкусно пахнуть и не вызывать неприятных эмоций

2.Можно ли верить вкусвиллу, который заявляет, что у них всё самое экологичное (полагаю, что нет). Кому тогда?

Читайте составы. Не считая откровенного контрафакта обычно по этикетке можно выбрать продукт. У Вкусвилла обычно состав полуфабрикатов поприличнее чем у массовых брендов.

3.Стоит ли закупаться на рынках? (кажется, совершенно нет никакой гарантии, и, возможно, там продукты те же, что и в магазинах)

Чего стоит опасаться, а чего нет?

Опасаться стоит в первую очередь нарушения регламентов хранения. Все продукты изначально происходят плюс-минус из одних и тех же мест, но у крупных сетей больше вероятность того, что продукт всю дорогу от завода до покупателя хранился в соответствии с правилами и регламентами.
Рынки (ИМХО) в мегаполисах - атавизм. Торговать своим - невыгодно. Если и есть вариант где-то купить реально своё - не факт, что оно выращивалось в лучших условиях чем "магазинное"

Доктор Сванн — на чью статью ты ссылаешься — не говорит о продуктах, они точно не знают почему так происходит. В 70-х когда фертильность была намного выше — много курили и использовали много запрещённых сейчас удобрений и вредных продуктов. Говорят, что скорее всего дело в пластиках. Там об этом есть тоже.

По продуктам — самое наивное думать это думать что продукты на рынках лучше чем в сетях. Они там хуже почти всегда. У мелких производителей нет возможностей правильно ухаживать за животными, и например забить стадо из-за подозрений в болезнях.СХ это дорогое и очень технологичное производство. Может в Австралии не так, но в РФ точно лучше покупать еду во Вкусвилл, чем у ноунеймов.

Я бы вообще не уделял уж больше внимание продуктам, у меня такие правила/практики: мы почти никогда не покупаем processed food — и стараемся избегать глютен — без него еда легче кажется.

вопрос сформулирован немного некорректно, потому что проблема то в основном касается России и при этом в разных регионах стоит по разному. Поэтому вопрос не про указывайте в страну, а указывайте регион.
мой старый пост на эту тему в основном про Питер
https://habr.com/en/post/405249/

Сейчас в Эстонии. Проблем с качеством продуктов нет, только с ценами (например дешевых огурцов вне сезона нет совсем)

"Как конкретно можно повысить качество покупаемых продуктов и готовой еды?"

Что делаю я (в Москве):

• беру продукты во вкусвилле, но это скорее по привычке, я не уверен, что у них сильно лучше, чем у остальных
• иногда выборочно замеряю уровень нитратов специальным прибором (летом так дыню выкинули)
• фильтрую воду в кувшине
• если есть выбор, то покупаю не самое дешёвое (полагаю, что в дешевом экономят на качестве/безопасности)

Чего не делаю, но хочется научиться:

• читать состав и знать чего лучше избегать
• знать, где можно закупаться с меньшим риском
• возможно, когда-нибудь в будущем начать выращивать свою зелень, но это из области фантастики пока
• найти каких-то хороших поставщиков мяса, но где, кого, как проверить - не ясно